41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1306 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  867    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  42.62 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  40.63 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  38.41 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  42.81 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  32.08 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  32.08 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  31.04 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  31.78 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  26.87 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.97 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  25.06 
 
 		 450 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  23.54 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  20.92 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  24.7 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  24.26 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  22.34 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.28 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  25.51 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  24.56 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  23.44 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  30.85 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  22.52 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  22.28 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.44 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  22.87 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.52 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  21.96 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  22.1 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  23.39 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.45 
 
 		 947 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  19.95 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  22.25 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  23.48 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  24.67 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  20.78 
 
 		 483 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  20.92 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  19.1 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  21.8 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  36.07 
 
 		 482 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  35.42 
 
 		 373 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.364595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>