73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5606 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  100 
 
 
438 aa  886    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  35.42 
 
 
353 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  28.5 
 
 
412 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  25.83 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  27.32 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  23.65 
 
 
483 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  25.12 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  27.17 
 
 
393 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  27.29 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  23.96 
 
 
453 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  26.37 
 
 
416 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  26.87 
 
 
414 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.8 
 
 
947 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  28.61 
 
 
430 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  26.33 
 
 
416 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  26.19 
 
 
412 aa  86.7  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  23.23 
 
 
450 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.62 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  24.67 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  22.86 
 
 
495 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  25.63 
 
 
614 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  25.77 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  26.42 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.78 
 
 
477 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  23.69 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  23.02 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  24.7 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  21.24 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.31 
 
 
482 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  20.5 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  21.35 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  21.35 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  24.85 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  22.65 
 
 
472 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.29 
 
 
476 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  26.24 
 
 
313 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.22 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.96 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.96 
 
 
877 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.14 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  24.69 
 
 
512 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  22.99 
 
 
445 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  22.16 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  23.7 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.77 
 
 
739 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  24.33 
 
 
431 aa  57.4  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  21.71 
 
 
435 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  23.9 
 
 
461 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.61 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  27.12 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  25.3 
 
 
366 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  49.02 
 
 
368 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  21.51 
 
 
474 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.19 
 
 
633 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.29 
 
 
257 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.67 
 
 
524 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  28.04 
 
 
530 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  30.12 
 
 
731 aa  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  26.17 
 
 
535 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.17 
 
 
528 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.24 
 
 
651 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  35.48 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.92 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.92 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  31.58 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.23 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.75 
 
 
372 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 
353 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  28.18 
 
 
410 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  26.6 
 
 
878 aa  43.9  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  24.11 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.23 
 
 
849 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>