50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4077 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1267    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  25.47 
 
 		 450 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  23.86 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  25.63 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  25.19 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.51 
 
 		 947 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  24.04 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  23.9 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  24.48 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  23.04 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.89 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  24.69 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  23.39 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  32.5 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  20.3 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  34.29 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.97 
 
 		 524 aa  56.6  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  23.37 
 
 		 412 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  20.66 
 
 		 418 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  32.06 
 
 		 421 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  22.73 
 
 		 463 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  24.67 
 
 		 416 aa  53.9  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  23.95 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  32.98 
 
 		 259 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  23.62 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  30.17 
 
 		 146 aa  50.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.64 
 
 		 383 aa  50.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  28.57 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 540 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  38.18 
 
 		 310 aa  47.8  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  37.88 
 
 		 411 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  33.33 
 
 		 369 aa  47.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  23.21 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  35.29 
 
 		 259 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  32.63 
 
 		 474 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  33.33 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  37.1 
 
 		 848 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  47.5 
 
 		 416 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  31.37 
 
 		 410 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  37.1 
 
 		 933 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  33.82 
 
 		 329 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  32.81 
 
 		 393 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  41.86 
 
 		 374 aa  44.3  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  30.23 
 
 		 964 aa  44.3  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  34.15 
 
 		 441 aa  44.3  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  39.22 
 
 		 933 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1071 aa  43.9  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  28.89 
 
 		 596 aa  43.9  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  36.07 
 
 		 747 aa  43.9  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1045 aa  43.9  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>