54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0642 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  905    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  38.5 
 
 
432 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  25.55 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  24.21 
 
 
482 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  25 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  23.49 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.27 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.18 
 
 
947 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  21.69 
 
 
483 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.21 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  23.91 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  24.34 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.15 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  23.84 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  22.83 
 
 
474 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  22.83 
 
 
495 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  28 
 
 
482 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.03 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  21.53 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.4 
 
 
353 aa  56.6  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  21.71 
 
 
438 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  21.05 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  21.05 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.72 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  22.25 
 
 
414 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.43 
 
 
877 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  23.95 
 
 
614 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  20.51 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.31 
 
 
425 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  21.77 
 
 
393 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  23.55 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  21.69 
 
 
438 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  33.33 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.86 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  47.92 
 
 
477 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  20.25 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  27.73 
 
 
512 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  38.71 
 
 
369 aa  46.6  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  27.56 
 
 
412 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.51 
 
 
633 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  23.51 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  24.49 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  28.95 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  25 
 
 
464 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  28.71 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  20.63 
 
 
472 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  23.43 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  42 
 
 
894 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  23.32 
 
 
414 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.78 
 
 
441 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.34 
 
 
396 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.18 
 
 
246 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.33 
 
 
524 aa  43.1  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  28.24 
 
 
746 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>