114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1303 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 418 aa  870    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  44.66 
 
 		 412 aa  329  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  38.24 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  38 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  30.54 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  30.41 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  25.83 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.53 
 
 		 947 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  22.65 
 
 		 393 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  25.95 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  24.44 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  27.6 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  24.56 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  27.69 
 
 		 433 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  29.04 
 
 		 495 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  25.21 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  22.85 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.26 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  22.31 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  24.14 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  28.52 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.05 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  30.36 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  22.39 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  22.39 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  21.74 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  23.48 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.24 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.91 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.79 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  21.69 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.04 
 
 		 524 aa  63.2  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  23.95 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  34.48 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  26.13 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  19.95 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.13 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  20.66 
 
 		 614 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  35.14 
 
 		 292 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  40.74 
 
 		 322 aa  53.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  22.73 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  26 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.11 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  21.54 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.95 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  20.89 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.15 
 
 		 633 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.87 
 
 		 877 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  42.11 
 
 		 747 aa  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.17 
 
 		 372 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  42.31 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.03 
 
 		 739 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  21.5 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  43.4 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  37.74 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  31.71 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.98 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  20.87 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  34.21 
 
 		 596 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  38.1 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  38.1 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  38.1 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  38.1 
 
 		 284 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  21.86 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  38.1 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  38.1 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  38.1 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  38.1 
 
 		 297 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  37.31 
 
 		 346 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  42 
 
 		 345 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  20.59 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  19.28 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  34.85 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  42.31 
 
 		 937 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.25 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  34.69 
 
 		 878 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  42.86 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  48.65 
 
 		 792 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  27.27 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  46.15 
 
 		 731 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  37.5 
 
 		 967 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.9 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  36.21 
 
 		 892 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  44.9 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  54.29 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  54.29 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  31.51 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  20.51 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.25 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  36.54 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  45.95 
 
 		 960 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  28.21 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  23.43 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  40.91 
 
 		 703 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  31.03 
 
 		 916 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  42.86 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>