52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0227 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  100 
 
 
877 aa  1781    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  48.51 
 
 
374 aa  361  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  39.51 
 
 
412 aa  260  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  25.49 
 
 
430 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  24.29 
 
 
474 aa  111  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  25.42 
 
 
431 aa  101  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  23.31 
 
 
476 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.8 
 
 
464 aa  98.2  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  26.15 
 
 
366 aa  97.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  26.46 
 
 
444 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  22.73 
 
 
450 aa  95.5  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.49 
 
 
482 aa  91.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  21.24 
 
 
482 aa  92  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  22.19 
 
 
433 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  23.73 
 
 
445 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.13 
 
 
477 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.82 
 
 
414 aa  87.4  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  23.28 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  21.23 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  20.6 
 
 
416 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  24.45 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  17.99 
 
 
472 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  22.55 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  19.62 
 
 
475 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  27.11 
 
 
432 aa  66.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  21.88 
 
 
408 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  21.79 
 
 
421 aa  66.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.99 
 
 
353 aa  64.3  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  22.6 
 
 
438 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.33 
 
 
441 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  24.88 
 
 
439 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  24.88 
 
 
439 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  23.21 
 
 
407 aa  61.2  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  21.53 
 
 
410 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  22.83 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  22.98 
 
 
369 aa  58.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.2 
 
 
633 aa  57.4  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  21.52 
 
 
435 aa  57.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  30.84 
 
 
416 aa  55.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.47 
 
 
947 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  19.54 
 
 
463 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  21.62 
 
 
313 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  35.35 
 
 
146 aa  50.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  29.76 
 
 
393 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  22.87 
 
 
418 aa  50.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  23.32 
 
 
495 aa  48.9  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  20.75 
 
 
417 aa  48.9  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  23.94 
 
 
345 aa  47.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  29.23 
 
 
453 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  21.07 
 
 
393 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  29.41 
 
 
412 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.99 
 
 
311 aa  44.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>