51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1426 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  880    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  38.5 
 
 
435 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  26.71 
 
 
483 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  25.18 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  26.09 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  23.31 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  24.07 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  25.15 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  21.59 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.38 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  24.12 
 
 
444 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  21.67 
 
 
482 aa  69.7  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  22.38 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  22.47 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  24.25 
 
 
467 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  22.52 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  23.13 
 
 
476 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  27.13 
 
 
877 aa  63.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  21.46 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  22.25 
 
 
450 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.92 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  22.89 
 
 
433 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  40 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  27.64 
 
 
512 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  21.64 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  30.82 
 
 
412 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  21.07 
 
 
453 aa  56.6  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  21.25 
 
 
431 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  23.62 
 
 
614 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  21.54 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.66 
 
 
383 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  22.64 
 
 
461 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  22.22 
 
 
472 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  27.56 
 
 
482 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.27 
 
 
477 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  20 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  20.05 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  20 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.68 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.27 
 
 
633 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  32.69 
 
 
413 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.03 
 
 
947 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  37.74 
 
 
345 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.48 
 
 
528 aa  46.6  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.78 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  21.08 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  22.15 
 
 
475 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  22.73 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  34.18 
 
 
313 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  22.93 
 
 
474 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
416 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>