40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0407 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  70.38 
 
 		 477 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  100 
 
 		 476 aa  988    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  57.51 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  27.27 
 
 		 430 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  24.09 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  24.61 
 
 		 444 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  24.11 
 
 		 412 aa  97.4  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.13 
 
 		 877 aa  94.4  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  25.12 
 
 		 475 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  25.48 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  22.98 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.89 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  32.42 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  21.29 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  20.97 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  24.91 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  22.63 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.37 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  36.99 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  24.03 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  22.52 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  20.81 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  22.6 
 
 		 313 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.23 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  35.14 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  35.14 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  22.56 
 
 		 393 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  23.41 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  39.68 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  22.63 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  25.75 
 
 		 467 aa  47  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.03 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  36.99 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.11 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  22.25 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  33.33 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  21.94 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  24.5 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.94 
 
 		 528 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>