More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1546 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  100 
 
 		 470 aa  966    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  52.26 
 
 		 684 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  38.8 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.07 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  36.8 
 
 		 459 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  37.1 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  33.33 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  35.24 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  35.19 
 
 		 448 aa  246  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.84 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  35.05 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  34.33 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  34.33 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  34.25 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  35.38 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  36.11 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  34.98 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  33.26 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.21 
 
 		 464 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  30.09 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  30.43 
 
 		 411 aa  194  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  30.7 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.53 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.62 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  34.35 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.16 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.68 
 
 		 471 aa  186  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  29.63 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  33.76 
 
 		 447 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  29.64 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.88 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  32.4 
 
 		 396 aa  176  8e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.33 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  29.41 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  33.05 
 
 		 441 aa  156  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.43 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  35.84 
 
 		 222 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  38.3 
 
 		 203 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  40.56 
 
 		 178 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  36.11 
 
 		 196 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  35.51 
 
 		 177 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  35.76 
 
 		 200 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  40.3 
 
 		 183 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  38.4 
 
 		 169 aa  90.9  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  38.14 
 
 		 247 aa  89.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  32.89 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  36.77 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.85 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.12 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  26.4 
 
 		 304 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.89 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.87 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.16 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.7 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.1 
 
 		 225 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.51 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.16 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.05 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  29.75 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  29.75 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  24.6 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  29.75 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.75 
 
 		 294 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  37.59 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  29.75 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  29.75 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  29.75 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  26.51 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  27.35 
 
 		 215 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  32.76 
 
 		 196 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.49 
 
 		 323 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  29.11 
 
 		 294 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.4 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.08 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.36 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.27 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.27 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.61 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  26.27 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.27 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  28.39 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  29.11 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.62 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  36.36 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.27 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.18 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  44.26 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.15 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.52 
 
 		 319 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.21 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.03 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4286  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.87 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.27 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.64 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.64 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.93 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  36.28 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>