More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0286 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0286  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
380 aa  775    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1367  protein of unknown function Met10  96.84 
 
 
380 aa  751    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  96.58 
 
 
380 aa  749    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  78.36 
 
 
381 aa  631  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  69.66 
 
 
381 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  37.43 
 
 
389 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  38.87 
 
 
395 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  37.39 
 
 
415 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  35.25 
 
 
393 aa  220  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  35.71 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  35.91 
 
 
418 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  33.24 
 
 
396 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  35.34 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  35.25 
 
 
393 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  33.63 
 
 
391 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.32 
 
 
392 aa  210  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  35.75 
 
 
391 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  34.93 
 
 
393 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  34.08 
 
 
394 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  35.48 
 
 
391 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  35.31 
 
 
390 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  35.54 
 
 
397 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  32.69 
 
 
391 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  30.85 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  34.25 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  33.43 
 
 
393 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  33.53 
 
 
400 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  28.65 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  28.65 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  28.65 
 
 
400 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  28.79 
 
 
408 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  32.14 
 
 
394 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  31.33 
 
 
404 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  33.16 
 
 
391 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  30.83 
 
 
404 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  27.95 
 
 
388 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  30.58 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  30.58 
 
 
404 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  30.5 
 
 
409 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 
396 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  29.62 
 
 
396 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  33.86 
 
 
418 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  34.58 
 
 
405 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  26.67 
 
 
389 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  30.38 
 
 
398 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 
396 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  33.42 
 
 
396 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  32.56 
 
 
398 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  33.07 
 
 
391 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 
396 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 
396 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  30.33 
 
 
404 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  30.33 
 
 
404 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  30.33 
 
 
404 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  33.42 
 
 
396 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  31.06 
 
 
411 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  30.48 
 
 
413 aa  176  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  33.16 
 
 
396 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  33.16 
 
 
396 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  31.63 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  26.41 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  31.41 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  35.63 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  31.65 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  31.64 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  30.92 
 
 
416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  32.64 
 
 
396 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  31.03 
 
 
411 aa  173  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  32.12 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  31.82 
 
 
398 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  33.51 
 
 
397 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  31.53 
 
 
384 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  31.82 
 
 
399 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  26.41 
 
 
389 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  31.14 
 
 
400 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  32.23 
 
 
397 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  28.46 
 
 
398 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1446  hypothetical protein  32.11 
 
 
390 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.721087  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  32.81 
 
 
397 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  33.68 
 
 
396 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  28.21 
 
 
398 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.57 
 
 
394 aa  169  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  30.91 
 
 
398 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  30.91 
 
 
398 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  30.59 
 
 
398 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  29.27 
 
 
397 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  31.61 
 
 
388 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  28.78 
 
 
422 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  31.19 
 
 
398 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  31.78 
 
 
404 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2204  PUA domain containing protein  32.36 
 
 
390 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000936736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  30.91 
 
 
398 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  30.91 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  31.12 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  32.74 
 
 
388 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
425 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  35.37 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  28.71 
 
 
423 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  29.53 
 
 
552 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  30 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>