84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0950 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  100 
 
 
501 aa  1023    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  26.41 
 
 
596 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  28.06 
 
 
540 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.83 
 
 
739 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.05 
 
 
703 aa  67  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  35.48 
 
 
599 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  36.67 
 
 
416 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.62 
 
 
391 aa  61.2  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  24.47 
 
 
916 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  30.87 
 
 
483 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.96 
 
 
266 aa  56.6  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  27.35 
 
 
731 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  23.75 
 
 
1106 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  30.58 
 
 
544 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  32.08 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  28.36 
 
 
967 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  46.81 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  46.81 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  46.81 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.85 
 
 
368 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  46.81 
 
 
227 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  21.9 
 
 
852 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.67 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.37 
 
 
350 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  42.59 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  19.39 
 
 
947 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  34.29 
 
 
294 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  20.9 
 
 
947 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  19.63 
 
 
651 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  34.29 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.94 
 
 
399 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  37.33 
 
 
230 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 
222 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  19.43 
 
 
982 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.33 
 
 
370 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  34.29 
 
 
294 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  44.68 
 
 
225 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  27.94 
 
 
463 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.29 
 
 
294 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  34.29 
 
 
294 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  34.29 
 
 
294 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  34.29 
 
 
294 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  34.29 
 
 
294 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.91 
 
 
373 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.29 
 
 
293 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.38 
 
 
395 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.51 
 
 
237 aa  47.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  34.48 
 
 
230 aa  47.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.51 
 
 
239 aa  47.4  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  26.92 
 
 
992 aa  47  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  29.89 
 
 
746 aa  47  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0346  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
636 aa  47  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  38.71 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.04 
 
 
293 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  39.62 
 
 
304 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.74 
 
 
305 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.33 
 
 
347 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  32.86 
 
 
294 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.55 
 
 
282 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.33 
 
 
259 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  22.08 
 
 
996 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.35 
 
 
633 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  27.38 
 
 
218 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  21.79 
 
 
878 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  23.3 
 
 
1003 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.47 
 
 
377 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  42.59 
 
 
309 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  34.41 
 
 
435 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.43 
 
 
483 aa  43.9  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.48 
 
 
314 aa  43.9  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  37.14 
 
 
414 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  33.93 
 
 
311 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.27 
 
 
220 aa  43.9  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.62 
 
 
283 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.51 
 
 
255 aa  43.5  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 
338 aa  43.5  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  19.83 
 
 
920 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  19.83 
 
 
920 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  28.57 
 
 
377 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 
389 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  35.19 
 
 
232 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  38.6 
 
 
312 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.71 
 
 
276 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>