51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2173 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  47.05 
 
 		 1003 aa  909    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  50.45 
 
 		 995 aa  967    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  51.42 
 
 		 979 aa  978    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  100 
 
 		 979 aa  2023    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  37.66 
 
 		 964 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  23.79 
 
 		 936 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.05 
 
 		 934 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1003 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1001 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  21.61 
 
 		 731 aa  95.5  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  26.89 
 
 		 996 aa  95.1  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  21.52 
 
 		 916 aa  87.8  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  21.91 
 
 		 651 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.86 
 
 		 703 aa  80.1  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  22.35 
 
 		 933 aa  79  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1106 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  20.68 
 
 		 933 aa  73.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  20.72 
 
 		 894 aa  69.7  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  23.9 
 
 		 920 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1008 aa  68.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  30.95 
 
 		 982 aa  68.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1279 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  20 
 
 		 972 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  20.45 
 
 		 969 aa  65.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  22.57 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  21.82 
 
 		 968 aa  63.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  22.8 
 
 		 747 aa  62.4  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  20.97 
 
 		 965 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  22.99 
 
 		 878 aa  59.3  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  29 
 
 		 906 aa  57.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1001 aa  55.5  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  25.13 
 
 		 848 aa  54.3  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  23.44 
 
 		 947 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  27.05 
 
 		 453 aa  52.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  27.98 
 
 		 968 aa  51.6  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  19.33 
 
 		 911 aa  51.6  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  19.33 
 
 		 911 aa  51.6  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  21.92 
 
 		 892 aa  51.6  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.31 
 
 		 1068 aa  51.2  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  30 
 
 		 792 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  25.41 
 
 		 937 aa  51.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  22.57 
 
 		 951 aa  50.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  24.26 
 
 		 961 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  24.83 
 
 		 746 aa  49.3  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  26.67 
 
 		 561 aa  49.3  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  22.83 
 
 		 852 aa  48.5  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  51.16 
 
 		 960 aa  48.1  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  47.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  44.44 
 
 		 969 aa  46.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1012 aa  45.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  42.22 
 
 		 962 aa  44.3  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>