More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2398 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  56.36 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  58.08 
 
 
329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  57.82 
 
 
287 aa  346  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  57.25 
 
 
311 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  46.95 
 
 
309 aa  279  4e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.77 
 
 
283 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.62 
 
 
294 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  34.23 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  34.23 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  34.23 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  34.23 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  34.23 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  34.23 
 
 
294 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  32.69 
 
 
311 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  34.62 
 
 
294 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  33.85 
 
 
294 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  34.14 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.47 
 
 
308 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.47 
 
 
308 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.15 
 
 
283 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  33.6 
 
 
304 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  34.36 
 
 
294 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  34.15 
 
 
283 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.15 
 
 
283 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  34.36 
 
 
294 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  34.36 
 
 
294 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  34.36 
 
 
294 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  34.36 
 
 
294 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.82 
 
 
282 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  34.82 
 
 
258 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.82 
 
 
282 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.82 
 
 
282 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  34.82 
 
 
282 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  34.82 
 
 
282 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  34.82 
 
 
282 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.41 
 
 
259 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31 
 
 
276 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.6 
 
 
283 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.6 
 
 
283 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34 
 
 
305 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  33.6 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.79 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  30.12 
 
 
283 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.72 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  33.33 
 
 
270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.46 
 
 
273 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4064  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.69 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.32 
 
 
304 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.05 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.96 
 
 
332 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.18 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.63 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.24 
 
 
286 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.62 
 
 
292 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  31.47 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.33 
 
 
305 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.61 
 
 
313 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.5 
 
 
293 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.4 
 
 
284 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.74 
 
 
276 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.29 
 
 
289 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.22 
 
 
303 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5892  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28 
 
 
319 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.2 
 
 
323 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.48 
 
 
284 aa  99  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0318  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.36 
 
 
282 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.09 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.8 
 
 
386 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2243  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.56 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000134525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.95 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.24 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7332  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.53 
 
 
345 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000215646  hitchhiker  0.0000000024237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  28.87 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.66 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.52 
 
 
314 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.51 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.19 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.68 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2756  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.12 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  29.08 
 
 
250 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  28.39 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.64 
 
 
319 aa  89.4  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  27.21 
 
 
380 aa  89.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  26.47 
 
 
301 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.84 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1434  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.67 
 
 
345 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.01 
 
 
391 aa  88.2  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.71 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  28.8 
 
 
451 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.74 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.99 
 
 
398 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  25.91 
 
 
378 aa  86.7  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.47 
 
 
379 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.84 
 
 
380 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.09 
 
 
259 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.02 
 
 
345 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.85 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.36 
 
 
464 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>