More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0988 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  86.1 
 
 
226 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  77.23 
 
 
223 aa  361  6e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  66.67 
 
 
225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  67.96 
 
 
225 aa  301  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  67.96 
 
 
225 aa  297  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  60.09 
 
 
215 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  57.92 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  53.2 
 
 
227 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  54.5 
 
 
227 aa  229  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  53 
 
 
227 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  52.5 
 
 
227 aa  223  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  51.23 
 
 
225 aa  222  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0028  putative DNA methylase  49.61 
 
 
261 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3720  DNA modification methylase-like protein  55.1 
 
 
131 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.51 
 
 
249 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  30.21 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.65 
 
 
258 aa  92.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.93 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.08 
 
 
382 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.65 
 
 
262 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.17 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.25 
 
 
419 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  29.71 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  29.95 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.87 
 
 
253 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  32.24 
 
 
266 aa  85.5  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.81 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  28.05 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  28.69 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.64 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  28.33 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  29.49 
 
 
421 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  29.02 
 
 
258 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  26.45 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.8 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.2 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.92 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  29.44 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  27.87 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.07 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.98 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.76 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  27.76 
 
 
372 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.76 
 
 
372 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.36 
 
 
408 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  25.33 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  25.33 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  28.75 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.53 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.53 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.23 
 
 
373 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.57 
 
 
367 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  26.42 
 
 
378 aa  75.5  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.57 
 
 
370 aa  75.5  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.38 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.38 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  27.09 
 
 
367 aa  75.1  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.9 
 
 
370 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.9 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  30.77 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0505  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.24 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.32 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.92 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.92 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  26.73 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  26.85 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  29.15 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  29.15 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  29.15 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  29.15 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  28.74 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  29.15 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  28.57 
 
 
265 aa  72  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  28.74 
 
 
294 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  28.78 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.17 
 
 
304 aa  71.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.74 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.03 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.56 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.32 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  28.74 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  27.27 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  26.91 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.95 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  27.27 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  28.78 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  27.27 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  26.91 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  27.27 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  27.5 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.1 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  27.27 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.08 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.03 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.39 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  26.59 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  27.39 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.44 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.46 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>