13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2428 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2428  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  684    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.939797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14610  hypothetical protein  47.97 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.308387  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2719  hypothetical protein  49.71 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03589  hypothetical protein  37.86 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2919  hypothetical protein  36.31 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2596  hypothetical protein  35.94 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002448  hypothetical protein  36.21 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  28.75 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  40 
 
 		 535 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  26.05 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  41.67 
 
 		 495 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 947 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>