More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1421 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1421  site-specific DNA-methyltransferase  100 
 
 
251 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0550  site-specific DNA-methyltransferase, putative  97.98 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.20676  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.1 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.77 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.46 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.12 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.45 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  26.22 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  26.22 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  29.53 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.9 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  28.93 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  25.33 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  53.45 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  32.89 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.03 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.13 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  34.03 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  34.03 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.46 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  34.03 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  34.53 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  34.03 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  33.33 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.69 
 
 
359 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  34.03 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  34.03 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.52 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  29.52 
 
 
230 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  24.9 
 
 
376 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.68 
 
 
389 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.55 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.19 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.67 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.39 
 
 
398 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  44.12 
 
 
378 aa  60.5  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  27.47 
 
 
377 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  30.99 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.27 
 
 
380 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  46.27 
 
 
377 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  25.88 
 
 
344 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  46.97 
 
 
368 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1954  DNA methylase  25.54 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000695995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  43.33 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.06 
 
 
372 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.3 
 
 
379 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48 
 
 
391 aa  58.5  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  43.28 
 
 
377 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.33 
 
 
370 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  43.28 
 
 
386 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  41.67 
 
 
372 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.12 
 
 
367 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  46.77 
 
 
380 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.28 
 
 
377 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.11 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.67 
 
 
372 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.17 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.65 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  44.83 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  44.12 
 
 
389 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  42.42 
 
 
379 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.47 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.63 
 
 
376 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.26 
 
 
329 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.65 
 
 
358 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.11 
 
 
376 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.02 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.18 
 
 
330 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 
382 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  45.45 
 
 
544 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.55 
 
 
368 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.15 
 
 
220 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.84 
 
 
315 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  25.44 
 
 
376 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.13 
 
 
421 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  36.36 
 
 
481 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.19 
 
 
379 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  30.22 
 
 
230 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  24.56 
 
 
377 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  48.39 
 
 
372 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.98 
 
 
276 aa  55.5  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  30.56 
 
 
294 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  30.56 
 
 
294 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  49.02 
 
 
436 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  30.56 
 
 
294 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  30.56 
 
 
294 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  30.56 
 
 
294 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  25.88 
 
 
377 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.36 
 
 
597 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.57 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.43 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 
334 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.12 
 
 
416 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  44.62 
 
 
367 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  41.38 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.45 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>