More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0201 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  41.78 
 
 
235 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  31.11 
 
 
1635 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  28.93 
 
 
272 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  31.09 
 
 
1085 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
272 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 
255 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
196 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
477 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  33 
 
 
253 aa  61.6  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
442 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  25.55 
 
 
231 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  29.91 
 
 
376 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  34.78 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
214 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
415 aa  58.9  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
1314 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.14 
 
 
345 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
1312 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  34.88 
 
 
303 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 
358 aa  54.7  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  37.17 
 
 
305 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4029  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.52 
 
 
299 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
1162 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
249 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  32.46 
 
 
488 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  30.95 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  32.61 
 
 
646 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
252 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  32.35 
 
 
323 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 
541 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
246 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
249 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
286 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
337 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
353 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  30.2 
 
 
310 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.73 
 
 
353 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.85 
 
 
420 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  32.08 
 
 
541 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  30.7 
 
 
203 aa  52  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
351 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  30.97 
 
 
242 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  26.55 
 
 
746 aa  52  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 
541 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 
541 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2662  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.03 
 
 
371 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.360692  normal  0.0481393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  32.08 
 
 
541 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
251 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  29.51 
 
 
300 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.68 
 
 
274 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 
264 aa  51.2  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
240 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
258 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  31.09 
 
 
332 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  29.93 
 
 
2112 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  33.96 
 
 
303 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  22.76 
 
 
417 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
256 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  32.43 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
1032 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
396 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
243 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
281 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5630  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.502531  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
1287 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  30.23 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  36.26 
 
 
449 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4233  Methyltransferase type 11  23.21 
 
 
293 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.351473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  33.33 
 
 
206 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  28.47 
 
 
212 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  27.75 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
231 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.06 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  32.08 
 
 
348 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  34.18 
 
 
298 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  26.19 
 
 
260 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  28.97 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  30.84 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  28.37 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  28.97 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  28.37 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
450 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  28.37 
 
 
229 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  28.37 
 
 
229 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
314 aa  48.9  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  30.23 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
282 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1605  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.3 
 
 
300 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  29.76 
 
 
231 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>