140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4233 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4233  Methyltransferase type 11  100 
 
 
293 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.351473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  33.62 
 
 
255 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  33.19 
 
 
252 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  33.19 
 
 
252 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  33.19 
 
 
255 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  33.19 
 
 
255 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  33.19 
 
 
252 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  32.76 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1115  methyltransferase type 11  33.19 
 
 
252 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4081  methyltransferase  32.48 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  37.22 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1260  methyltransferase  32.05 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  32.67 
 
 
205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0929  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
251 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  29.74 
 
 
281 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
284 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  29.55 
 
 
287 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  25.91 
 
 
614 aa  92  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3433  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
2046 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
733 aa  56.2  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  28.47 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  28.47 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.71 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.09 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  28.06 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  26.37 
 
 
211 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.06 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  23.21 
 
 
185 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  28.49 
 
 
207 aa  49.7  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.48 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  27.34 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  27.75 
 
 
212 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  24.49 
 
 
658 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  32 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2745  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
482 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.91 
 
 
482 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
286 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1633  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.61 
 
 
431 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00552168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25 
 
 
345 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.23 
 
 
201 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  26.76 
 
 
394 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 
419 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  28 
 
 
221 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  22.83 
 
 
227 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1647  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.68 
 
 
436 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0262651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  23.23 
 
 
423 aa  45.8  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1720  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.53 
 
 
440 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.87 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  22.58 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  27.56 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28 
 
 
237 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
854 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  28.17 
 
 
394 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.44 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  29.3 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2130  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  25.74 
 
 
376 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2228  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.87 
 
 
427 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  22.79 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2219  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  29.75 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.84 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  25.18 
 
 
207 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
236 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>