133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3717 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  100 
 
 
261 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1719  Methyltransferase type 12  68.42 
 
 
262 aa  351  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6182  hypothetical protein  65.48 
 
 
299 aa  349  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011056  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0432  type 12 methyltransferase  65.43 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.418019  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2928  hypothetical protein  34.67 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1606  methyltransferase type 12  30.71 
 
 
278 aa  92  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278757  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0473  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0289469  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2638  methyltransferase type 12  35.16 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00142392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 
853 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  28.67 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
283 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  35.88 
 
 
330 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  29.51 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  31.9 
 
 
535 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  35.45 
 
 
387 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  35.45 
 
 
387 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  35.45 
 
 
387 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0813  small-molecule methyltransferase IraA  28.38 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0784  small-molecule methyltransferase IraA  28.38 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7790  methyltransferase type 12  29.05 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0190194  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  28.44 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  26.9 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.94 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3433  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  28.44 
 
 
290 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  28.23 
 
 
244 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.79 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.19 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  28.44 
 
 
290 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.56 
 
 
356 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
614 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.09 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
277 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
265 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.92 
 
 
207 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 
299 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
307 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
2046 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  32.74 
 
 
205 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  28.44 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  29.46 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.04 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1260  methyltransferase  26.83 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
224 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.19 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  29.84 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  33.93 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  25.82 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
2490 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  28 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  28.97 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
367 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.14 
 
 
561 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.14 
 
 
561 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.82 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  30.14 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  31.93 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.37 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.58 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  29.1 
 
 
204 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.58 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  31.34 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 
320 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  30 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  27.05 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
317 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  32.82 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4233  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.351473 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>