42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2928 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2928  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  463  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6182  hypothetical protein  40.49 
 
 		 299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  34.67 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0432  type 12 methyltransferase  35.87 
 
 		 337 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.418019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1719  Methyltransferase type 12  36.57 
 
 		 262 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0473  methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0289469  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1606  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278757  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2638  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00142392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  30.92 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  30.26 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  30.26 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  30.14 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  30.26 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  30.26 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  30.26 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  33.61 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  22.69 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  30.61 
 
 		 287 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4081  methyltransferase  28.29 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1260  methyltransferase  28.29 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1115  methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0929  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  30.26 
 
 		 351 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.36 
 
 		 426 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.567073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 575 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1154  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.29 
 
 		 383 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  23.62 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  21.37 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3433  methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 279 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  22.13 
 
 		 585 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.3 
 
 		 426 aa  42.4  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.3 
 
 		 426 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  27.59 
 
 		 290 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  27.59 
 
 		 290 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  22.76 
 
 		 196 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2293  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.66 
 
 		 414 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000690855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>