58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0432 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0432  type 12 methyltransferase  100 
 
 
337 aa  670    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.418019  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  65.59 
 
 
261 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1719  Methyltransferase type 12  63.2 
 
 
262 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6182  hypothetical protein  62.5 
 
 
299 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011056  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2928  hypothetical protein  34.13 
 
 
224 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0473  methyltransferase type 12  28.5 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0289469  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1606  methyltransferase type 12  29.02 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278757  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
272 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.77 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  28.47 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  28.47 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  24.53 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  28.68 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
614 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
211 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
275 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
283 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
204 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
263 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
204 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
284 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.36 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  29.84 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2638  methyltransferase type 12  30.97 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00142392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
268 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.52 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1260  methyltransferase  25.9 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
196 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  25.66 
 
 
252 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.99 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  25.66 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  32.43 
 
 
1914 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
209 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  25.66 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  30.07 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  25.66 
 
 
252 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
204 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  25.66 
 
 
252 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
272 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  25.66 
 
 
255 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
241 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 
215 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.79 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  26.39 
 
 
290 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  27.81 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>