More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4709 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3433  methyltransferase type 11  63.31 
 
 		 279 aa  361  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1260  methyltransferase  40 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0929  methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4081  methyltransferase  39.17 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1115  methyltransferase type 11  39.67 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  37.76 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  38.17 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  37.76 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  37.76 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  36.93 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  39.9 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 211 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  34.75 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  38.92 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  35.86 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 614 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 2046 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4233  Methyltransferase type 11  29.74 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.351473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 2490 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  26.09 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  28.12 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  28.42 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.69 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.08 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.77 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  30.77 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2749  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 471 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1719  Methyltransferase type 12  34.96 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  28.57 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  29.37 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  40.79 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  24.72 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  40.79 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.81 
 
 		 410 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.6 
 
 		 201 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 196 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 199 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 254 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.3 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.88 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.91 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  25.34 
 
 		 280 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  30.47 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  33.57 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 354 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>