More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3050 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1260  methyltransferase  35.93 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  36.07 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4081  methyltransferase  35.5 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0929  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  35.62 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  35.62 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  35.62 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  35.62 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  39.01 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  35.16 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  35.16 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1115  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  38.92 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3433  methyltransferase type 11  39.86 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  34.48 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 2046 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  33.5 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 614 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4233  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 293 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.351473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.08 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.32 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.65 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  26.53 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.92 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.99 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.42 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.97 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.37 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  34.33 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1326  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.71 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.21 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 854 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 733 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.4 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  32.59 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.4 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 417 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.15 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  30 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2928  hypothetical protein  26.35 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.47 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  30.77 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  30 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 624 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.4 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.8 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6182  hypothetical protein  28.03 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.26 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.62 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.69 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.08 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.13 
 
 		 305 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.75 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.14 
 
 		 306 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.81 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>