63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0898 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4233  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.351473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  39.13 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1260  methyltransferase  36.17 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4081  methyltransferase  35.32 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1115  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  33.47 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  33.47 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  33.47 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  33.47 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  33.47 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  33.05 
 
 		 252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  32.63 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0929  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  31.49 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3433  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 614 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 2046 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02190  actin binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07150)  29.34 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0738312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2928  hypothetical protein  22.69 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263693  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71233  predicted protein  29.85 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.532537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  27.33 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  24.39 
 
 		 290 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  25.12 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  24.03 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  25.4 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  25.4 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  28 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  25.4 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.89 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  29.06 
 
 		 347 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1719  Methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0432  type 12 methyltransferase  29.08 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.418019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  24.67 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  29.23 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6182  hypothetical protein  28.21 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 585 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.17 
 
 		 457 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0487  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.92 
 
 		 434 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 244 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1357  methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>