128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2925 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  63.29 
 
 
586 aa  796    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  100 
 
 
585 aa  1214    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  46.09 
 
 
575 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  43.14 
 
 
535 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  44.04 
 
 
522 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  40.24 
 
 
560 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  49.04 
 
 
226 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  47.09 
 
 
228 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  49.04 
 
 
226 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  48.56 
 
 
226 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  48.79 
 
 
226 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  28 
 
 
551 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  38.5 
 
 
236 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
198 aa  130  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  33.98 
 
 
208 aa  124  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  38.65 
 
 
202 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  41.14 
 
 
214 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  30.7 
 
 
212 aa  96.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
201 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.54 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  28.8 
 
 
213 aa  58.9  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  22.17 
 
 
208 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  27.65 
 
 
192 aa  57.4  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2304  hypothetical protein  36.99 
 
 
381 aa  54.3  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  25.32 
 
 
192 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  22 
 
 
200 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.83 
 
 
269 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 
222 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 
1287 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
246 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 
232 aa  50.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  25.13 
 
 
208 aa  50.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  25 
 
 
257 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  28.81 
 
 
237 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
269 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 
274 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  26.88 
 
 
214 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  26.88 
 
 
214 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
252 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  28.97 
 
 
266 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  28.93 
 
 
199 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
274 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  28.21 
 
 
207 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
255 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  24.84 
 
 
252 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  24.84 
 
 
255 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  24.84 
 
 
255 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  24.84 
 
 
252 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  24.84 
 
 
255 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  24.67 
 
 
274 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  24.84 
 
 
252 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  31.71 
 
 
246 aa  48.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  23.68 
 
 
248 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
246 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  23.68 
 
 
248 aa  47.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  22.97 
 
 
192 aa  48.1  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  27.22 
 
 
202 aa  47.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  22.36 
 
 
252 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  24.04 
 
 
195 aa  47.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  26.85 
 
 
524 aa  47.4  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  27.42 
 
 
266 aa  47.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.07 
 
 
244 aa  47  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
293 aa  47  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  28.93 
 
 
207 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.57 
 
 
291 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.43 
 
 
250 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  26.98 
 
 
354 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  33.85 
 
 
208 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
265 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  22.55 
 
 
279 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 
331 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  24.52 
 
 
193 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
242 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.2 
 
 
251 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0345  hypothetical protein  32.14 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.215943  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
243 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  24.73 
 
 
200 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  21.62 
 
 
225 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  25 
 
 
252 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
369 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.27 
 
 
258 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  31.67 
 
 
355 aa  45.4  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.86 
 
 
278 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  42 
 
 
374 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.19 
 
 
251 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  27.52 
 
 
222 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  26.84 
 
 
207 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  26.61 
 
 
236 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
225 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  27.48 
 
 
256 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  20.9 
 
 
215 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
213 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  27.5 
 
 
322 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
238 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
364 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
330 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  22.35 
 
 
202 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 
208 aa  45.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>