More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3306 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  97.45 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  85.57 
 
 		 196 aa  345  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  57.44 
 
 		 201 aa  218  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  57.75 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  57.75 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  57.75 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  57.75 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  57.22 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  57.22 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  51.04 
 
 		 202 aa  191  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  54.87 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  52.82 
 
 		 200 aa  187  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  52.82 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  52.31 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  52.31 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  51.28 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  51.79 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  43.78 
 
 		 551 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  31.43 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.56 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  29.27 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 575 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.05 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  28.95 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  34.62 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.43 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  31.88 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  26.86 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.43 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  27.65 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  27.94 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  30.73 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  28.85 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  29.05 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  24.86 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.82 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  26.67 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  25.58 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 		 1287 aa  55.1  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  34 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.64 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  25 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  36.89 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  34 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.48 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  36.73 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.53 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.17 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.17 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0944  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase  33.67 
 
 		 263 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.07 
 
 		 237 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  25.64 
 
 		 330 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  34.15 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  34.95 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  24.17 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>