126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2004 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  100 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  43.65 
 
 
575 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  45.08 
 
 
560 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  44.38 
 
 
535 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  38.5 
 
 
585 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  45.41 
 
 
214 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  43.87 
 
 
522 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  39.27 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  42.65 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  42.16 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  42.16 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  42.01 
 
 
586 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  41.67 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  37.95 
 
 
228 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  32.82 
 
 
208 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
551 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.79 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  33.63 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  32.74 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  32.03 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  32.03 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  36.36 
 
 
201 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  37.37 
 
 
201 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  36.36 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  25.15 
 
 
196 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.09 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8636  methyltransferase type 12  34.09 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  34.78 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  26.14 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
203 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
250 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  34.95 
 
 
423 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  28.39 
 
 
202 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  22.73 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  25.32 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  32.48 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  29.25 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.67 
 
 
282 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  33.62 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  32.76 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  24.49 
 
 
192 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  28.21 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  27.7 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.48 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
441 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
441 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 
277 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.4 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  28.91 
 
 
198 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  31.13 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  28.12 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  28.12 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
257 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2936  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.97 
 
 
390 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  28.79 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  31.54 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.4 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  34.23 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  28.45 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2277  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  47.37 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>