26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2240 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  97.79 
 
 
226 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  96.46 
 
 
226 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  95.13 
 
 
226 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  52.86 
 
 
228 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  49.28 
 
 
585 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  46.04 
 
 
575 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  44.29 
 
 
586 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  42.44 
 
 
560 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  42.79 
 
 
198 aa  141  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  47.5 
 
 
522 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  46.25 
 
 
535 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  33.82 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
236 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 
202 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  41.14 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  34.33 
 
 
212 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  30.73 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  33.55 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  28.76 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  25.17 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  29.27 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
202 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  25.93 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>