221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00128 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  47.34 
 
 		 560 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  45.88 
 
 		 575 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  43.03 
 
 		 535 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  47.37 
 
 		 522 aa  131  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  37.37 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  41.2 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  40 
 
 		 226 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  39.5 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  38.65 
 
 		 585 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  39.5 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  39.5 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  39.32 
 
 		 586 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  34.01 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  44.62 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 551 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  31.1 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  31.65 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  31.33 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  31.33 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  31.33 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  31.33 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  31.33 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  31.33 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  26.17 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  27.52 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.14 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  36.7 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  24.49 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  27.56 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  32.17 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  26 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  26 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  27.4 
 
 		 1287 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1019  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 364 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 306 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  29.05 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  25.14 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  37.96 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  25.5 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.69 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  41.03 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 276 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  39.56 
 
 		 249 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 282 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  38.46 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.57 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  28.91 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  37.5 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  23.72 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  41.46 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  34.19 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  22.97 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.54 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  27.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  24.84 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 2112 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  22 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  27.91 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  35.37 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  23.98 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>