271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5472 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  56.35 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  48.73 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  33.84 
 
 		 575 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  37.24 
 
 		 560 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  32 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  34.94 
 
 		 522 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  34.33 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  33.83 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  34.33 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  32.16 
 
 		 535 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  29.27 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 585 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  29.49 
 
 		 586 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 551 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  33.83 
 
 		 292 aa  62  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  32.33 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  37.61 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  37.61 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  38.53 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  37.61 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  26.71 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  29.41 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  38.26 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  31.09 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  25.34 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  32 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  29.66 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  33.87 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  35.78 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  35.14 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.19 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  29.08 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  36.94 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  35.25 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  31.3 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  22.34 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  22.34 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  35.04 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  25.68 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2936  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  29.29 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  22.34 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.15 
 
 		 390 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  23.73 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  40 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  28.77 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  29.53 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  22.05 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  26.92 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  28.28 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  28.28 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.65 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  28.28 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8636  methyltransferase type 12  29.27 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  24.82 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  32.08 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  26.21 
 
 		 277 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.35 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  36.56 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  32.08 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  28.15 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  32.08 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  28.15 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  32.08 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.25 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  28.15 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.25 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  32.08 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>