184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1409 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  71.35 
 
 		 192 aa  303  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  57.22 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  47.4 
 
 		 192 aa  200  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  46.49 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  41.97 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  43.75 
 
 		 1287 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  39.69 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  39.49 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  35.86 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  34.39 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  34.39 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  38.22 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  39.88 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  39.24 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  38.41 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  39.24 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  39.13 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  37.24 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  36.02 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  38.96 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  38.22 
 
 		 201 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  29.33 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.12 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 575 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  31.47 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  31.88 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  28.93 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  27.23 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  27.18 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  27.18 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30.22 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.69 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  26.9 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  32.24 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  32.24 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  32.24 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.19 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  32.43 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  26.58 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  27.22 
 
 		 535 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  26.56 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 585 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 551 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  27.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.72 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 560 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  27.04 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.37 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.32 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.06 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  32.32 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.77 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  31.31 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.43 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.66 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.67 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  28.03 
 
 		 522 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2349  hypothetical protein  43.94 
 
 		 85 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.504297  normal  0.779927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  29.77 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  30.84 
 
 		 400 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.53 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  31.54 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>