More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2514 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  100 
 
 
208 aa  434  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  58.5 
 
 
208 aa  240  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  57.21 
 
 
218 aa  231  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  60.1 
 
 
208 aa  231  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  56.04 
 
 
209 aa  230  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  54.59 
 
 
208 aa  229  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  56.78 
 
 
211 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  54.68 
 
 
207 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  54.23 
 
 
207 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  53.47 
 
 
208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  54.4 
 
 
208 aa  214  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  50.72 
 
 
213 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  49.28 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  27.8 
 
 
202 aa  89  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  29.41 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  28.35 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  29.08 
 
 
1287 aa  79.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  28.21 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  27.59 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  27.59 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  27.55 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  31.85 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  32.39 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  31.85 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  26.43 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  24.19 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
214 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  32.39 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  23.08 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  28.36 
 
 
377 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  30.56 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
291 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
261 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  30.14 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  25 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  27.09 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  25.81 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  29.55 
 
 
377 aa  52.4  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  31.58 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0083  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
250 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1586  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.728643  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  25.61 
 
 
232 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
210 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 
551 aa  51.6  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.95 
 
 
575 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.92 
 
 
390 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1503  hypothetical protein  29.24 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  27.54 
 
 
365 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.68 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  35 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  33.04 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.19 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
264 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1283  hypothetical protein  28.65 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0336066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  31.78 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  31.78 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  31.78 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  28.85 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.26 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.96 
 
 
241 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  31.78 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  31.78 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
264 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  35.56 
 
 
262 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  26.02 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  31.94 
 
 
202 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.95 
 
 
230 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  32.04 
 
 
325 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  26.5 
 
 
400 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
293 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  26.45 
 
 
252 aa  48.5  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  28.44 
 
 
298 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.46 
 
 
345 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  33.82 
 
 
423 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>