90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0687 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  53.37 
 
 		 440 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  41.48 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  31.03 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  30.11 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  30.93 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  31.44 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  30.45 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  30.34 
 
 		 1287 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  27.72 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.7 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.14 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  29.7 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  27.72 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  28.02 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  27.93 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  27.93 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  22.75 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.28 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  29.85 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  28.02 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  23.03 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  24.68 
 
 		 575 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  34.16 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  29.77 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  29.91 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  29.01 
 
 		 298 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 551 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  37.78 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.99 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  27.78 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  25.64 
 
 		 298 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  23.47 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.37 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 585 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  28.76 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  37.31 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1267  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 350 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  34 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  26.56 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.65 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12451  hypothetical protein  40.7 
 
 		 348 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.741785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  34.4 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  27.89 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  26.62 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  26.62 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  26.62 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.53 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  26.62 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  26.62 
 
 		 201 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  26.62 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 249 aa  41.6  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>