More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4053 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  100 
 
 
207 aa  423  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  72.82 
 
 
218 aa  321  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  73.66 
 
 
208 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  72.59 
 
 
207 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  72.41 
 
 
209 aa  305  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  70.71 
 
 
208 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  67.16 
 
 
211 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  65.07 
 
 
213 aa  289  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  70.05 
 
 
208 aa  287  6e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  66.67 
 
 
208 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  65.28 
 
 
208 aa  269  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  57.92 
 
 
210 aa  258  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  54.68 
 
 
208 aa  225  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  33.66 
 
 
1287 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  34.54 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  35 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  30.2 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  42.55 
 
 
250 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  28.04 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  30.16 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  31.28 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  27.23 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  33.74 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 
195 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  31.85 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.45 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.45 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  33.81 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  24.73 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  27.65 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
317 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  31.39 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  30.51 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  27.75 
 
 
226 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  27.95 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  28.12 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.36 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  30.51 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  30.51 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  28.95 
 
 
488 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  30.51 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  30.51 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  34.16 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  32.39 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  30.13 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  27.38 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
291 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.82 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.27 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  30.89 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  32.84 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  31.12 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  25.17 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
305 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  33.9 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 
323 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
323 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.83 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
551 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
269 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  31.09 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.9 
 
 
386 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
270 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
346 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  33.1 
 
 
303 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  33.55 
 
 
303 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
197 aa  51.6  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
218 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 
353 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  28.93 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.54 
 
 
353 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  28.22 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  29.78 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  30 
 
 
286 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>