More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1032 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  79.13 
 
 		 211 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  68.12 
 
 		 208 aa  298  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  68.12 
 
 		 208 aa  288  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  65.87 
 
 		 208 aa  287  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  66.67 
 
 		 209 aa  286  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  64.73 
 
 		 207 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  63.77 
 
 		 213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  66.67 
 
 		 207 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  63.77 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  66.83 
 
 		 218 aa  278  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  57.62 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  58.5 
 
 		 208 aa  240  9e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  33.17 
 
 		 1287 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  34.44 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  28.5 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.06 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 364 aa  71.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  28.74 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  28.74 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  29.8 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.46 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  30.87 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  30.2 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  35.21 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  32.77 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  36.89 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30.38 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  29.49 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  26.04 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.62 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  26.74 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  27.98 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  28.1 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 551 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  28 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  29.92 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  28.85 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  31.01 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  28.85 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  27.81 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  28.85 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  28.85 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 		 255 aa  51.6  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  28.85 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  28.85 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  36 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.36 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.68 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  25.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.61 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.08 
 
 		 345 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  31.73 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  30.1 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.43 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  30 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.64 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>