132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01393 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  84.1 
 
 		 522 aa  922    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1102    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  43.97 
 
 		 575 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  42.14 
 
 		 586 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  43.16 
 
 		 560 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  45.4 
 
 		 228 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  48.75 
 
 		 226 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  46.88 
 
 		 226 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  46.25 
 
 		 226 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  44.38 
 
 		 236 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  46.25 
 
 		 226 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  43.03 
 
 		 202 aa  133  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 198 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  48.12 
 
 		 214 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  36.36 
 
 		 208 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  32.16 
 
 		 212 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 201 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  22.29 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  28.82 
 
 		 214 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  28.82 
 
 		 214 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  54.7  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  29.86 
 
 		 192 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 220 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  38.83 
 
 		 410 aa  54.3  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 202 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 		 238 aa  54.3  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  30.51 
 
 		 195 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 196 aa  52.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 199 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 222 aa  51.6  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.76 
 
 		 229 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  32 
 
 		 201 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 222 aa  50.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  30.4 
 
 		 266 aa  50.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  32 
 
 		 201 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  36.89 
 
 		 223 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 233 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 223 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.06 
 
 		 202 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.2 
 
 		 208 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 208 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 246 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 252 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.3 
 
 		 196 aa  47.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 262 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.36 
 
 		 263 aa  47.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.2 
 
 		 207 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  29.6 
 
 		 270 aa  47.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 249 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  32.38 
 
 		 249 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 225 aa  47  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.09 
 
 		 211 aa  47  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  34.62 
 
 		 207 aa  47  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 265 aa  47  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 226 aa  47  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 218 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 222 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 		 1162 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 218 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  36.05 
 
 		 249 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 		 250 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  28 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.19 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.3 
 
 		 248 aa  45.8  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 242 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 		 215 aa  45.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  29.36 
 
 		 209 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  24.05 
 
 		 225 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 		 253 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.36 
 
 		 253 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 204 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2688  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 256 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 259 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 220 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4697  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.67 
 
 		 216 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 249 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 202 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.98 
 
 		 232 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  24.05 
 
 		 225 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5162  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.67 
 
 		 216 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.12 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.36 
 
 		 238 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 217 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  28 
 
 		 242 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  28 
 
 		 242 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  28 
 
 		 242 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 220 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>