122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5435 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  52.24 
 
 
202 aa  204  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  36.22 
 
 
440 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  46.38 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  32.62 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.44 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.91 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
195 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  32.69 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  32.39 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  35.24 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.86 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  28.86 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.29 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  27.64 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
195 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
222 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  27.64 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  26.44 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
364 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.73 
 
 
1287 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  23.72 
 
 
575 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  30.56 
 
 
212 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  40 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  27.27 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  27.27 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  25.76 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  34.58 
 
 
234 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
214 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  27.5 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  25.42 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  34.29 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  27.51 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.56 
 
 
390 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.5 
 
 
200 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  26.27 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  30.77 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0859  QbsJ-like methyltransferase  31.71 
 
 
366 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.226018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2850  Methyltransferase type 12  22.14 
 
 
227 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852328  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  27.17 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  26.97 
 
 
201 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
281 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  26.36 
 
 
535 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  25.91 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  21.11 
 
 
585 aa  45.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  26.98 
 
 
196 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
283 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  36.7 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  25.89 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  26.38 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  34.34 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  30 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  35.34 
 
 
267 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  29.25 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3775  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  34.19 
 
 
267 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
298 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  25.36 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  30.33 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  26 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  36.46 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  22.15 
 
 
522 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  26.23 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1364  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.594154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  32.38 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25.36 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  22.41 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.41 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  25.36 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  26 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  25.36 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  26 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  26 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  26 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.05 
 
 
236 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  25.36 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000671  SAM-dependent methyltransferase  28.46 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.3 
 
 
258 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>