More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2771 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  78 
 
 		 200 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  73.74 
 
 		 200 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  65.15 
 
 		 200 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  50.52 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  52.79 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  49.48 
 
 		 195 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  47.75 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  47.19 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  41.29 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  40.51 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  42.86 
 
 		 1287 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  39.13 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  41.13 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  33.78 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  37.06 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  31.18 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  31.18 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  32.05 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  44.34 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  35.06 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  35.07 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.76 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  35.83 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 364 aa  68.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  33.59 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.49 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  31.13 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  33.07 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  31.2 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  31.2 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  31.33 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  31.2 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  31.2 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  35.24 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  31.2 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  31.2 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  28.65 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  31.2 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  30.85 
 
 		 440 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  29.76 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.89 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  29.6 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  30.4 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  30.19 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  29.84 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  31.82 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.82 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.69 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.04 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  32.14 
 
 		 323 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  27.69 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  28.43 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 257 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  37.38 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.22 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.59 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  27.56 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  29.34 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  30.15 
 
 		 309 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>