239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0257 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  71.15 
 
 		 208 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  70.67 
 
 		 209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  71.15 
 
 		 208 aa  304  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  66.67 
 
 		 213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  68.29 
 
 		 218 aa  290  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  66.18 
 
 		 207 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  66.18 
 
 		 208 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  65.87 
 
 		 211 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  63.77 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  65.28 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  62.69 
 
 		 210 aa  257  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  54.4 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  36.55 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  32.14 
 
 		 1287 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  31.25 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  30.81 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  31.94 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  30.56 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  30.13 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  30.13 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  33.13 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  32.53 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  30.86 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  28.92 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  25.16 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  31.76 
 
 		 440 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.05 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  30.27 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  34.21 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  35.9 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 305 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  25.39 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  29.25 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  28.24 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  27.73 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  23.33 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 323 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 323 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  28.22 
 
 		 341 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 365 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  39 
 
 		 423 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  28.32 
 
 		 335 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1564  conserved hypothetical protein, possible methyltransferase  27.72 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.17 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.82 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 276 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 551 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  27.67 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  27.81 
 
 		 377 aa  48.5  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.8 
 
 		 390 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  30.19 
 
 		 298 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.63 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  26.81 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 303 aa  48.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.66 
 
 		 258 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30 
 
 		 244 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  24.55 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.16 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>