59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1131 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  401  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  98.96 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  49.22 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  48.45 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  47.19 
 
 		 199 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  45.03 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  44.5 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  45.51 
 
 		 200 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  39.79 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  39.24 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  38.89 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  36.49 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  34.76 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  37.24 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  41.44 
 
 		 1287 aa  79.7  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  32.14 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  32.14 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  33.99 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  31.17 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  30.25 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  28.17 
 
 		 440 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  27.64 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  33.59 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.58 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  37.23 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  23.47 
 
 		 575 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  28.93 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.22 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  27.85 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1527  hypothetical protein  29.36 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.38 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 195 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.4 
 
 		 203 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  26.92 
 
 		 239 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 585 aa  41.2  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>