More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0486 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  72 
 
 		 213 aa  314  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  71.15 
 
 		 208 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  70.19 
 
 		 209 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  72.41 
 
 		 208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  72 
 
 		 218 aa  301  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  70.79 
 
 		 207 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  68.12 
 
 		 208 aa  298  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  69.31 
 
 		 208 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  70.05 
 
 		 207 aa  287  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  66.83 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  59.52 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  54.59 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  34.44 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  33 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.65 
 
 		 1287 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  37.28 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  28.76 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  27.15 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  27.15 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  32.49 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  31.47 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  29.2 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  30.36 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.79 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  29.59 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  31.33 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.25 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  26.16 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  28.65 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  28.66 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.11 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  29.25 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  25.58 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  28.66 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  24.87 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  31.33 
 
 		 440 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.73 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 246 aa  51.6  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.29 
 
 		 345 aa  51.6  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.11 
 
 		 253 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 261 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  23.4 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  37.27 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  31.25 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 585 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  28.36 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  31.58 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>