More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1090 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  59.8 
 
 		 390 aa  259  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  44.33 
 
 		 201 aa  201  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  40.7 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  42.53 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  39 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  42.05 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  27.65 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  31.69 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  28.41 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  27.48 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  29.86 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  37.39 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  38.02 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  33.97 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  32.69 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  32.69 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  23.5 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  39.13 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  36.29 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  27.11 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  24.71 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  27.98 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  34.74 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.17 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  31.97 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.65 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.15 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  27.5 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.01 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  38.54 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.41 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  24.83 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.91 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.82 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  28.33 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  27.27 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  34.48 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  30.63 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  34.48 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.17 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  32.65 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  31.03 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.37 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2156  methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.29498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  29.82 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>