276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0899 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  100 
 
 		 201 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  61 
 
 		 200 aa  267  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  46.97 
 
 		 199 aa  207  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  44.95 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  42.65 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.65 
 
 		 390 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  31.01 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  28.93 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  23.49 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.7 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  23.19 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  28.35 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  25.21 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.14 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  27.86 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  25.75 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.41 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  27.78 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  20.26 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.69 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  36.54 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  29.77 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  31.73 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.58 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  33.01 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  31.73 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  30.69 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.15 
 
 		 258 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 279 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.48 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 266 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  26.28 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 277 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.26 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  26.15 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2950  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.429444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  29.1 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  29.63 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.48 
 
 		 261 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.21 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  44 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  27.94 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 305 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  30.37 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 442 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 281 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.44 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  22.7 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  28.8 
 
 		 258 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  30.77 
 
 		 1287 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  30.19 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.4 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.35 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  25.98 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.95 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>