123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2196 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  47.06 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  48.13 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  31.64 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  34.72 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.28 
 
 		 390 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4186  hypothetical protein  74.47 
 
 		 57 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  31.39 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  34.23 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  33.54 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  31.17 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  25.28 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 241 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0768  methyltransferase type 12  30.58 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.36 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.32 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  25.17 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  31.43 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  31.43 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  26.24 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.94 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  27.61 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  27.61 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 268 aa  48.9  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.23 
 
 		 244 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 249 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.43 
 
 		 296 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  30.36 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.62 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31.73 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  27.48 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0877  hypothetical protein  36.99 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  33.64 
 
 		 263 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  24.52 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  55 
 
 		 263 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 252 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  23.84 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  31.75 
 
 		 272 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 248 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  32.11 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  31.54 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  32.32 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  26.67 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 317 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6235  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 262 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 415 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.97 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  37.33 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 252 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  23.18 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 303 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  31.31 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  28.67 
 
 		 423 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  30 
 
 		 2112 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.65 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1085 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>