139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1170 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  48.45 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  43.01 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  44 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  36.27 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  46.31 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  35.75 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  32.99 
 
 		 390 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  36.87 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  23.23 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  31.07 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.21 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.94 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  32.45 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  36.61 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  20.26 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 257 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 249 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  33.01 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  23.74 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.48 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  41.25 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  25.63 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  29.29 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.07 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 244 aa  48.5  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  31.64 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  28.44 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  28.7 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  29.33 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  28.7 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  32.1 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  23.58 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  27.11 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  28.95 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  31.33 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 272 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  27.84 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  23.78 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  29.52 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  29.52 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  29.52 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  34.48 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 260 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 238 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.62 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  30.12 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  28.91 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.72 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  30.12 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  23.45 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  28.32 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  28.32 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  41.1 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  32.17 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  27.46 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  35.14 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  29.63 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  28.81 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  35.58 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  35.65 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0786  Methyltransferase type 12  25.3 
 
 		 539 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  30.77 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.91 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>