More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1188 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  100 
 
 
201 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  100 
 
 
201 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  100 
 
 
201 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  87.06 
 
 
201 aa  348  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  82.91 
 
 
201 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  69.65 
 
 
201 aa  280  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  72.64 
 
 
201 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  63.13 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  59.7 
 
 
201 aa  235  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  60.3 
 
 
199 aa  232  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  61.22 
 
 
423 aa  229  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  58.29 
 
 
201 aa  223  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  58.79 
 
 
201 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  65.05 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  58 
 
 
200 aa  197  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  54.55 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  54.08 
 
 
205 aa  176  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  48.92 
 
 
203 aa  174  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  45.6 
 
 
192 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  40.51 
 
 
259 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  38.07 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  45.28 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  34.9 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 
264 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
249 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  38.1 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
250 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  31 
 
 
237 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
257 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.73 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  36.61 
 
 
575 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
254 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  26.81 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.29 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.08 
 
 
238 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
304 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
228 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.29 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  29.45 
 
 
235 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.14 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.19 
 
 
258 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 
238 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  29.31 
 
 
253 aa  54.7  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  23.5 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.97 
 
 
390 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  23.5 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
540 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  26.75 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.37 
 
 
541 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  38.05 
 
 
232 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
240 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  23.12 
 
 
291 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  23.65 
 
 
272 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  32.48 
 
 
258 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  34.86 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.37 
 
 
541 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  32.28 
 
 
541 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  27.63 
 
 
263 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  29.82 
 
 
541 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
201 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.86 
 
 
235 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
267 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  32.2 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  29.82 
 
 
541 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.46 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  28.68 
 
 
208 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  35 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.57 
 
 
251 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  25.52 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.85 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.11 
 
 
257 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  52.08 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.79 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  31.86 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  36.11 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
244 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  33.04 
 
 
273 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
996 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
246 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>