88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2524 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  57.22 
 
 		 192 aa  224  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  54.26 
 
 		 192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  53.19 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  44.97 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  44.15 
 
 		 202 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  45.5 
 
 		 1287 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  41.71 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  38.83 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  38.83 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  40 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  45 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  39.72 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  40 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  39.57 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  41.13 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  34.76 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  34.76 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  36.96 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  30.43 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  30.05 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  31.09 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  31.94 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.89 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  32.35 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  27.84 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 575 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  24.62 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  28.12 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 560 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  24.61 
 
 		 551 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  25.29 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  30.51 
 
 		 535 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  23.19 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 303 aa  48.9  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  24.82 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35.09 
 
 		 296 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  26.99 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  24.04 
 
 		 585 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.29 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.38 
 
 		 390 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  34.07 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.06 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  22.33 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  31.15 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  25.5 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  27.62 
 
 		 522 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  25.14 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  21.85 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  26.38 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  25.93 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2349  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.504297  normal  0.779927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  26.23 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  25.93 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  26.72 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7298  hypothetical protein  35.94 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  22.17 
 
 		 586 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  27.59 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  35.62 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  24.75 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.35 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  32.56 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  23.74 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 218 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 241 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  31.15 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  20.99 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  24.82 
 
 		 280 aa  41.2  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>