More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  46.49 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  44.15 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  41.45 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  41.62 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  44.1 
 
 		 1287 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  38.74 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  38.89 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  38.89 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  40.56 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  34.72 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  34.72 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  31.66 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 203 aa  97.8  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  38.73 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  33 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  37.06 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  35.96 
 
 		 201 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  34.16 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  33.82 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  35.54 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  34.15 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  29.95 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.12 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  35 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  30.92 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  32.16 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  29.77 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 575 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  30.73 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.81 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  25.63 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  29.27 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  28.29 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  28.95 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  28.95 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  28.95 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  28.95 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  28.95 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  28.95 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  30.52 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  25.5 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  25.63 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  26.45 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  32.77 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.63 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  29.94 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  29.37 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 241 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  34.45 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  33.98 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  38.16 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  31.9 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  30.53 
 
 		 311 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  25.26 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>