203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2456 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  96.57 
 
 		 204 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  89.85 
 
 		 200 aa  329  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  88.89 
 
 		 201 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  88.89 
 
 		 201 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  87.88 
 
 		 201 aa  324  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  85.79 
 
 		 201 aa  314  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  68.21 
 
 		 201 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  65.59 
 
 		 201 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  65.59 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  65.05 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  65.05 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  65.05 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  65.05 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  51.28 
 
 		 196 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  51.79 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  51.02 
 
 		 196 aa  187  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  48.73 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 		 551 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  41.58 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.21 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  39 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  26.13 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  38.95 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.48 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  36.67 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  24.35 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.78 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  34.55 
 
 		 535 aa  55.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  26.75 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  28.49 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  29.27 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  29.88 
 
 		 1287 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 319 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  28.3 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  37.27 
 
 		 522 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  36.45 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  28.44 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  26.09 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 364 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.42 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  31.17 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  36.56 
 
 		 540 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.69 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  30.69 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  30.69 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  30.69 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 291 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  24.46 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 		 289 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  32.5 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.71 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  24.24 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.78 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  34.26 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  30.69 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  38.38 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  31.63 
 
 		 440 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  29.7 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  29.7 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 252 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  35.34 
 
 		 410 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  32.71 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  29.7 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>