More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3350 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  100 
 
 
267 aa  551  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.96 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  31.5 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.8 
 
 
387 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.8 
 
 
387 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  28.8 
 
 
387 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  27.5 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 
288 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.43 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.49 
 
 
215 aa  55.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  30 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  30.46 
 
 
202 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  25.12 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 
227 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.11 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  28.28 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  35 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
209 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
248 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
248 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.04 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
253 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.29 
 
 
259 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
241 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3428  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
254 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 
234 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  31.17 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  24.64 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  35.05 
 
 
239 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.91 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.2 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.42 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  29.59 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.7 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.35 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1042  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
195 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.85 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.67 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1307  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.88 
 
 
394 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.48 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.77 
 
 
205 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
575 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.39 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
214 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  34.02 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.09 
 
 
202 aa  48.9  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
415 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
305 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 
240 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.26 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
220 aa  48.9  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.32 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  33.68 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
199 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  26.26 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1123  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.88 
 
 
394 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0181843  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  32.46 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  31.29 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1747  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.32 
 
 
382 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00423906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  32.47 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1560  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.32 
 
 
382 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138047  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1916  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.32 
 
 
382 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0810656  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.1 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  31.43 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  33.02 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.4 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.91 
 
 
434 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1523  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.32 
 
 
382 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>